(1) 經濟或有發展性作物肥培管理技術改進研究。

A.雲嘉南地區設施作物肥培管理技術之研究。

B.不同肥培管理對改進凱特芒果品質之研究。

C.不同肥培管理對茂谷柑裂果之研究。

D.外銷蘭花肥培管理之研究

(2) 推動合理化施肥措施。

A.雲嘉南地區土壤與植體營養診斷服務。

B.合理化施肥：推動柑橘、芒果、洋香瓜、酪梨、楊桃、木瓜之合理化施肥。

C.集水區肥培管理示範

D.微生物肥料示範推廣：毛(大)豆、紅豆及落花生根瘤菌接種示範推廣；內生菌根應用於瓜類之示範推廣。

E.綠肥作物栽培及示範推廣

F.淺層土壤滴灌栽培技術示範。

(3) 抗逆境（乾旱浸水等）微生物肥料之研究。

A.接種內生菌根對作物生育及環境評估與應用之研究。

(4) 酸性土壤改良：酸性土壤改良示範。

2.進行農業廢棄物資源化研究，以降低生產成本，維護自然生態環境減少環境污染，促進農業資源合理利用，並增進地力。

3.氣候變遷及農業氣象對農作物的影響研究，以提供未來國際研擬氣候變遷綱要公約之數據及決策參考。如推動我國溫室氣體減量基準；制定溫室氣體管制法；建立溫室氣體排放權交易制度；推動跨國共同減量計畫。

(1) 全球氣候變遷對台灣地區現行耕作制度下溫室氣體之釋放及減量研究。

(2) 台灣地區現行耕作制度對水稻田和旱田甲烷氣體排放減量之影響。

4.協助辦理農作物污染損害監測管制。